本書根據(jù)農業(yè)生物的特點,系統(tǒng)介紹了蛋白質組學的基礎理論和研究方法,反映了蛋白質組學研究的最新成果。本書內容主要包括蛋白質組學的基本概念、樣品全息化制備技術、雙向電泳技術、生物質譜與蛋白質鑒定、圖譜分析與生物信息學等內容;同時結合基礎理論部分內容,收集、整理、選擇了部分國內外蛋白質組學研究在農業(yè)領域中應用的最新進展,闡明了蛋白質組學技術在農業(yè)領域中應用的途徑。為了提高讀者對本書的理解,每章后附有思考題。
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序言
目錄
前言
第一章 緒論 1
第一節(jié) 蛋白質組學形成的歷史沿革 1
第二節(jié) 蛋白質組學的研究內容與技術路線 7
第三節(jié) 蛋白質組學在系統(tǒng)生物學中的地位 7
第四節(jié) 蛋白質組學的發(fā)展趨勢 9
第五節(jié) 農業(yè)生物蛋白質組學的研究現(xiàn)狀與前景 12
思考題 22
主要參考文獻 22
第二章 蛋白質樣品的全息制備 24
第一節(jié) 蛋白質樣品裂解液成分分析 24
第二節(jié) 細胞裂解與蛋白質提取 30
第三節(jié) 蛋白質的分離與純化 41
第四節(jié) 亞細胞器的分離與蛋白質提取 48
第五節(jié) 蛋白質樣品的濃縮、干燥及保存 54
思考題 56
主要參考文獻 56
第三章 雙向凝膠電泳 57
第一節(jié) 雙向凝膠電泳 57
第二節(jié) 凝膠中蛋白質檢測 66
第三節(jié) 蛋白質印跡 73
第四節(jié) 圖像采集與后續(xù)分析 76
第五節(jié) 雙向電泳技術的局限性和發(fā)展方向 79
第六節(jié) 雙向電泳中的問題與原因分析 80
第七節(jié) 毛細管電泳技術簡介 85
思考題 87
主要參考文獻 87
第四章 蛋白質組學中的液相色譜 89
第一節(jié) 高效液相色譜 89
第二節(jié) 反相色譜 93
第三節(jié) 多維液相色譜 100
思考題 102
主要參考文獻 103
第五章 電泳圖譜的圖像分析 104
第一節(jié) 雙向電泳圖譜分析 104
第二節(jié) 雙向電泳圖譜分析技術要點 116
第三節(jié) 雙向電泳數(shù)據(jù)庫和網上比較 117
第四節(jié) 雙向電泳蛋白質譜數(shù)據(jù)庫構建 121
思考題 123
主要參考文獻 123
第六章 生物質譜技術與蛋白質鑒定 124
第一節(jié) 生物質譜基本原理 124
第二節(jié) 質譜技術在鑒定蛋白質中的應用 146
思考題 160
主要參考文獻 161
第七章 蛋白質翻譯后修飾的鑒定 162
第一節(jié) 磷酸化蛋白質的鑒定 163
第二節(jié) 糖基化蛋白的鑒定 184
第三節(jié) 泛素化蛋白的鑒定 195
第四節(jié) 其他翻譯后修飾 199
思考題 200
主要參考文獻 201
第八章 定量蛋白質組學研究技術 202
第一節(jié) 熒光雙向差示凝膠電泳技術 202
第二節(jié) 穩(wěn)定同位素代謝標記技術 211
第三節(jié) 穩(wěn)定同位素的體外標記方法 216
思考題 222
主要參考文獻 222
第九章 蛋白質-蛋白質相互作用 224
第一節(jié) 蛋白質-蛋白質相互作用的類型與研究意義 224
第二節(jié) 蛋白質互作的分析原理 226
第三節(jié) 蛋白質免疫共沉淀 230
第四節(jié) 酵母雜交系統(tǒng) 234
第五節(jié) 噬菌體展示技術 246
第六節(jié) 蛋白質微陣列和芯片技術 248
第七節(jié) 串聯(lián)親和純化技術 259
第八節(jié) 其他蛋白質-蛋白質相互作用研究技術簡介 262
思考題 269
主要參考文獻 269
第十章 蛋白質組生物信息學 271
第一節(jié) 生物信息學簡介 271
第二節(jié) 主要相關網站和數(shù)據(jù)庫 281
第三節(jié) 通過序列相似性搜索數(shù)據(jù)庫 296
第四節(jié) 質譜識別蛋白質方法 310
思考題 318
主要參考文獻 318
第十一章 蛋白質組學技術在作物科學研究中的應用 319
第一節(jié) 作物蛋白質組學研究的技術特點 319
第二節(jié) 作物遺傳多樣性分析 321
第三節(jié) 作物器官與發(fā)育生物學 325
第四節(jié) 作物不育性機理 331
第五節(jié) 作物遺傳作圖 334
第六節(jié) 作物抗病相關蛋白 336
第七節(jié) 作物抗脅迫相關蛋白 340
思考題 348
主要參考文獻 348
第十二章 蛋白質組學技術在動物科學研究中的應用 350
第一節(jié) 動物蛋白質組學研究的特點 350
第二節(jié) 畜禽、昆蟲遺傳多樣性 352
第三節(jié) 畜禽、家蠶生殖與發(fā)育 353
第四節(jié) 家蠶、害蟲免疫與抗逆生理 356
第五節(jié) 畜禽產品質量相關性狀 359
第六節(jié) 畜禽疾病生理 361
第七節(jié) 水生生物疾病生理 365
思考題 372
主要參考文獻 372
第十三章 蛋白質組學在微生物研究中的應用 374
第一節(jié) 微生物蛋白質組學研究的技術特點 375
第二節(jié) 生物防治微生物作用機理 376
第三節(jié) 植物病原微生物致病相關蛋白的鑒定 378
第四節(jié) 食源性病原微生物相關蛋白的鑒定 382
第五節(jié) 微生物固氮相關蛋白 391
第六節(jié) 微生物環(huán)境脅迫相關蛋白的鑒定 392
第七節(jié) 微生物降解農業(yè)廢棄物與農化物質相關蛋白的鑒定 395
思考題 397
主要參考文獻 397