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微生物關(guān)聯(lián)推斷生物信息學(xué)研究及應(yīng)用 讀者對(duì)象:本科及研究生
了解微生物之間以及微生物與環(huán)境之間如何交互,是微生物生態(tài)學(xué)的重要研究課題。然而,由于傳統(tǒng)的基于實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的研究方法存在一定局限性,因此,生物學(xué)家對(duì)真實(shí)環(huán)境中微生物群落內(nèi)部的交互了解甚少。宏基因組測(cè)序及人工智能技術(shù)的發(fā)展使得研究人員可以通過分析微生物基因組序列來了解真實(shí)環(huán)境中微生物的組成和豐度,并構(gòu)建關(guān)聯(lián)推斷算法分析微生物群落中的復(fù)雜交互作用。本書首先對(duì)微生物宏基因組測(cè)序及其分析流程進(jìn)行介紹,其次詳細(xì)介紹了構(gòu)建關(guān)聯(lián)推斷算法需要考慮的問題,最后對(duì)基于統(tǒng)計(jì)和人工智能的多種微生物關(guān)聯(lián)推斷算法進(jìn)行探討,并闡述了基于自然語言構(gòu)建微生物關(guān)聯(lián)知識(shí)圖譜的新思路。在關(guān)聯(lián)推斷算法的介紹過程中,本書以基于腸道菌群疾病的輔助診斷和太湖藍(lán)藻水華問題為例,介紹了相關(guān)方法在微生物研究中的應(yīng)用。
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